Từng là một trụ cột của ĐTVN, Huy Hùng cùng với Hoàng Thịnh tạo ra bộ đôi tiền vệ trung tâm số 1 Việt Nam dưới thời HLV Miura. Nhưng sau khi HLV Hữu Thắng lên nắm quyền, Huy Hùng tỏ ra không có duyên với đội tuyển khi liên tiếp gặp phải những chấn thương để rồi không thể tham dự AFF Cup cuối năm vừa qua.
Trở lại sau chấn thương dẫn đến bị gạch tên khỏi danh sách tham dự AFF cup 2016, Huy Hùng đã nỗ lực không ngừng trong quá trình tập luyện lấy lại phong độ tại CLB Quảng Nam. Hồi phục hoàn toàn chấn thương Huy Hùng trở lại thi đấu ấn tượng nơi hàng tiền vệ đội bóng xứ Quảng, góp công lớn trong chuỗi trận ấn tượng vừa qua của đội bóng, để rồi tiếp tục được HLV Hữu Thắng triệu tập lên ĐTQG.
Trở lại ĐTQG, trước khi được ra sân trong trận đấu với Afghanistan, Huy Hùng đã nhận được những lời khen từ HLV Hữu Thắng ở trận giao hữu với Đài Loan. Tuy ĐTVN không giành được thắng lợi trong trận giao hữu đó nhưng Huy Hùng được đánh giá là một trong những cầu thủ chơi ổn định nhất khi đội tuyển mới tập trung trở lại.
Trong trận đấu với Afghanistan vừa qua, Huy Hùng được HLV Hữu Thắng xếp đá chính ở trung tâm hàng phòng ngự bên cạnh Xuân Trường. Không có những đường kiến tạo thường xuyên cho tuyến trên như Xuân Trường, Huy Hùng thi đấu thầm lặng hơn, nhưng đóng góp một vai trò quan trọng không kém trong lối chơi của ĐTVN.
Giữ vai trò một tiền vệ phòng ngự, chơi lùi hơn so với Xuân Trường, "Busquets Việt Nam" nhận nhiệm vụ tranh chấp và thu hồi bóng. Liên tục phải xuất hiện ở những điểm nóng trên sân Huy Hùng cho thấy sự mạnh mẽ và điềm tỉnh trong lối chơi cùng những pha xử lý tinh tế tạo khoảng trống cho Xuân Trường phát triển bóng.
Thi đấu thấp nhất ở hàng tiền vệ nhưng đôi khi cầu thủ sinh năm 1992 làm giúp nhiệm vụ của Xuân Trường bằng những pha mở bóng ra 2 biên cùng những pha ban bật vào trung lộ. Pha dứt điểm nguy hiểm đầu tiên của ĐTVN đến từ cú sút xa của Huy Hùng, điều đó chứng tỏ sự đa năng trong cả công lẫn thủ của cầu thủ thuộc biên chế Quảng Nam FC.
Cùng với Xuân Trường hoàn thành tốt nhiệm vụ quán xuyến khu vực trung tuyến của ĐTVN trước những cầu thủ to cao của đội tuyển Afghanistan, Huy Hùng đã khẳng định cho sự trở lại sau khi nằm ngoài kế hoạch tại AFF Cup vừa qua. Đồng thời đó cũng là lời đáp lại sự tin tưởng của ông thầy khi Huy Hùng được chọn thi đấu bên cạnh Xuân Trường.