Những án phạt này được FIFA đưa ra nhằm trừng phạt đội bóng "xứ vạn đảo" vì vi phạm ở nhiều trận đấu khác nhau.
Án phạt đầu tiên mà FIFA áp dụng cho tuyển Indonesia là cảnh cáo vì trì hoãn trận đấu với đội tuyển Úc vào ngày 10/9/2024. Tiếp theo, Indonesia bị phạt 10.000 Franc Thụy Sĩ (khoảng 11.000 USD) vì ra sân muộn khi đối đầu với đội tuyển Trung Quốc vào ngày 15/10/2024.
Một án phạt nghiêm trọng khác dành cho ông Sumardji, Giám đốc đội tuyển Indonesia, người đã bị phạt 5.000 Franc Thụy Sĩ (gần 6.000 USD) và cấm làm nhiệm vụ trong một trận đấu. Lý do là vì ông có hành vi phản ứng quá mức với trọng tài trong trận đấu với Bahrain ngày 10/10/2024, khi Indonesia để đối thủ gỡ hòa 2-2 trong thời gian bù giờ. Trong trận đấu này, trọng tài đã cộng thêm 10 phút thay vì 6 phút như thông báo ban đầu, dẫn đến bàn gỡ hòa của Bahrain ở phút cuối cùng khiến Indonesia đánh rơi chiến thắng.
Cuối cùng, trợ lý HLV Kim Jong-jin cũng phải nhận án phạt nặng từ FIFA. Ông bị phạt 5.000 Franc Thụy Sĩ (gần 6.000 USD) và cấm tham gia nhiệm vụ 4 trận do phản ứng không đúng mực trong cùng trận đấu với Bahrain.
Tổng cộng, Indonesia phải nộp phạt gần 23.000 USD. Những án phạt này có thể sẽ ảnh hưởng lớn đến đội bóng khi họ chuẩn bị đối đầu với Nhật Bản và Saudi Arabia trong hai trận kế tiếp vào tháng 11 tới. Sau 4 trận, Indonesia đang đứng thứ 5/6 đội tại bảng C với 3 điểm, cơ hội đi tiếp là rất mong manh, đặc biệt khi phải đối mặt với những “ông kẹ” hàng đầu châu Á ở các lượt đấu sắp tới.